[新型コロナ関連論文]南アフリカにおけるオミクロン懸念される変異株（VOC）の臨床的重症度の早期評価
[新型コロナ関連論文]南アフリカにおけるオミクロン懸念される変異株（VOC）の臨床的重症度の早期評価
2022.03.22
SARS-CoV-2のオミクロンVOCが、2021年11月に南アフリカで検出され、COVID-19の新規感染者数の増加に関係しています。
著者らは、サーモフィッシャーサイエンティフィックPCR検査におけるSpike Gene Target Failure（SGTF）を用いたオミクロンVOCの臨床的重症度の評価を目的としました。
このため、南アフリカCOVID-19ケースデータ、SARS-CoV-2ラボ検査データ、SARS-CoV-2ゲノムデータ、COVID-19入院データとデータリンクを実施しました。
TaqPath PCR検査による個人の診察、感染は、SGTFまたは非SGTFで示されました。
デルタ株はゲノム・シークエンスによって検出されました。
2021年10月1日から11月30日の期間に、多重ロジスティック回帰分析モデルを用いて、重症度と入院を、SGTFと非SGTFで診察された個人を比較によって評価し、更に、2021年10月1日～11月30日の期間にSGTF感染個人と、2021年4月1日～11月9日の期間にデルタ株感染個人を、比較により重症度を更に比較しました。
この結果、2021年10月1日（39週）から12月6日（49週）に、328ケースのCOVID-19が南アフリカで報告されました。
38,282人がTaqPath PCRテストで診察され、29,721人がSGTF感染、1412非SGTF感染が確認されました。
SGTF感染割合は、39週に63中2（3.2%）から、48週に22,455中21,937（97.9%）へ増加しました。
入院に関係する要素をコントロールした後に、SGTF感染個人は、入院オッズ（≒見込み）が、非SGTF感染と比較して著しく低くなりました（10,547中256（2.4%） vs 948中121（12.8%）；調整オッズ比0.2、95％Cl 0.1~1.3）。
重症度に関係する要素をコントロールした後に、重症度オッズは、SGTF感染入院した個人と非SGTF感染の間で、類似していました（204中42（21%） vs 113中45（40%）；オッズ比0.7、95％Cl 0.2~0.5）。
重症度に関係する要素をコントロールした後に、早期デルタ株感染個人と比較したところ、SGTF感染個人は、重症度のオッズは著しく低いものでした（793中496（62.5%） vs 244中57（23.4%）；オッズ比0.3、95％Cl 0.2~0.5）。
このことから、同時期に診察されたSGTF感染個人 vs 非SGTF感染個人間の入院オッズは著しく低い結果でした。
SGTF感染個人は、早期デルタ株感染個人と比較して、重症度のオッズを著しく減少させました。
いくつかのこの減少した重症度は、以前の後退によるものかもしれません。
ご興味をお持ちいただけましたら、以下のリンクをご参照ください。
